A repülő flotta technikailag érinthetetlen. A valódi kockázat az, ha távollétedben vagy egy pillanatnyi figyelmetlenség miatt kikötve hagyod.
Az Aleryos játékban nincs hold, és holdpusztítás sincs. A már repülő flottát ezért ilyen mechanikával nem lehet elfogni.
Ezzel szemben a támadások nagyon gyorsak lehetnek. A távolságtól és az alkalmazott sebességtől függően egy bolygót, ahol a flottád kikötve marad, akár 2 perc 30 másodperc alatt is megtámadhatnak. Ezért maradj figyelmes, amikor a flottád egy bolygón állomásozik.
A védelme érdekében szoktasd magad ahhoz, hogy repülésre küldöd, amikor kijelentkezel, vagy amikor nem tudod figyelni a fiókodat. Elküldheted valamelyik saját bolygódra, vagy a célodtól függően egy külső célpontra.
Hosszabb távollét esetén tegyél egy lassú hajót a flottába. A csoport teljes sebességét a leglassabb egység határozza meg, így meghosszabbíthatod az utazási időt, és a repülést a távolléted időtartamához igazíthatod.
Használd a csillagközi érzékelőket is: ezekkel megtekintheted a beérkező és távozó flottákat, így hatékonyabban reagálhatsz, ha egy flotta közeledik, vagy fontos mozgás van folyamatban. A „Megkeresés a galaxisban” gomb kattintáskor a térképet a flotta pozíciójára középre állítja, ha a pályája elérhető. Ha a térképen egy flottára kattintasz, megnyílik annak érzékelőlapja, az arra jogosult flottáidnál pedig megmarad a megszokott emlékeztető. A Beállítások > Szerver menüben elrejtheted az érzékelőkön a még túl távoli ellenséges támadásokat; ezek automatikusan újra megjelennek, amint belépnek a kiválasztott időablakba. Ez a szűrő csak az érzékelőket érinti. A térképen továbbra is láthatók az ellened irányuló támadások és a Kóborlók szövetségeseid ellen irányuló támadásai.

