Os heróis são personagens interfacções adicionados gradualmente: tornam-se disponíveis assim que são implantados e progridem ao cumprir suas missões compatíveis. Cada um tem dois espaços para acessórios.
A página Facção > Heróis lista apenas os heróis realmente disponíveis, sem exibir espaços futuros. Um herói pode estar livre ou atribuído a uma missão; permanece indisponível durante essa atribuição, mas uma mudança de facção não interrompe uma missão já iniciada.
Cada herói tem sua própria lista de missões compatíveis, seus bônus e suas regras de experiência. A seleção de uma missão exibe apenas os heróis compatíveis. Para Mira Venn, o ganho de experiência por hora durante as Escavações está detalhado em Heróis em Escavações. Naël Soryn recebe 400 XP ao final de cada Hack de Pilares de 30 minutos, mesmo que seja detectado ou que nenhum movimento seja observado; o Codex aumenta esse ganho de acordo com seu nível. Mira e Naël progridem pelos 20 níveis, até 112 650 XP.
Um acessório que o jogador possui só pode ser equipado em um herói por vez. Só é possível equipar ou desequipar acessórios quando o herói está livre, inclusive após uma mudança de facção. Os acessórios e a progressão do herói permanecem pessoais do jogador. O catálogo de acessórios e as regras de transferência estão descritos em Acessórios dos heróis.