Eine Ausgrabung ist eine bodengebundene PvE-Mission, die über Operationen → Säulen → Ausgraben gestartet wird. Sie schickt ein Team zu einer archäologischen Stätte, um seltene Ressourcen oder Zubehörfragmente zu gewinnen. Dabei besteht die Möglichkeit, eine feindliche Präsenz zu erwecken.
Ausgrabungen sind unabhängig von Erkundungen: Sie benötigen keine Flotte, werden nicht von der äußeren Umgebung beeinflusst und können nicht manuell zurückgerufen werden. Jede belegt einen Platz im globalen Kontingent aktiver Missionen; die Obergrenze und die Zählweise sind unter Start und Anzahl der Ausgrabungen beschrieben.
Jede Planetenposition von 1 bis 10 erhält dauerhaft ein zufälliges Stättenprofil. Das Profil bleibt bestehen, solange der Standort nicht kolonisiert ist. Eine Ausgrabung kann jedoch nicht auf einer bereits besetzten Position gestartet werden. Mehrere Spieler können dieselbe freie Stätte gleichzeitig ausgraben: Ihre Missionen und Ergebnisse bleiben vollständig unabhängig voneinander. Ein Spieler kann an derselben Koordinate jeweils nur eine aktive Ausgrabung haben.

