Les héros sont des personnages transversaux ajoutés progressivement : ils deviennent disponibles dès leur déploiement et progressent en accomplissant leurs missions compatibles. Chacun dispose de deux emplacements d'accessoires.
La page Faction > Héros liste uniquement les héros réellement disponibles, sans afficher d'emplacements futurs. Un héros peut être libre ou affecté à une mission ; il reste indisponible pendant cette affectation, mais un changement de faction n'interrompt pas une mission déjà lancée.
Chaque héros possède sa propre liste de missions compatibles, ses bonus et ses règles d'expérience. La sélection d’une mission n’affiche que les héros compatibles. Pour Mira Venn, le gain d'expérience par heure de Fouille est détaillé dans Héros en Fouille. Naël Soryn reçoit 400 XP à la fin de chaque Piratage par Piliers de 30 minutes, même s'il est détecté ou qu'aucun mouvement n'est observé ; le Codex augmente ce gain selon son niveau. Mira et Naël progressent sur 20 niveaux, jusqu'à 112 650 XP.
Un accessoire possédé ne peut être équipé que sur un seul héros à la fois. L'équipement et le déséquipement ne sont possibles que si le héros est libre, y compris après un changement de faction. Les accessoires et la progression du héros restent personnels au joueur. Le catalogue et les règles de transfert des accessoires sont décrits dans Accessoires des héros.