Iskopavanje je kopnena PvE misija pokrenuta iz Operacije → Stupovi → Iskopati. Šalje ekipu na arheološko nalazište kako bi izvukla rijetke resurse ili fragmente dodataka, uz mogućnost buđenja neprijateljske prisutnosti.
Iskopavanja su neovisna o istraživanjima: ne zahtijevaju flotu, na njih ne utječe vanjsko okruženje i ne mogu se ručno opozvati. Svako zauzima jedno mjesto u ukupnoj kvoti aktivnih misija; ograničenje i način brojanja opisani su u Pokretanje Iskopavanja i njihov broj.
Svaka planetarna pozicija od 1 do 10 trajno dobiva nasumični profil nalazišta. Profil ostaje prisutan dok lokacija ne bude kolonizirana, ali Iskopavanje se ne može pokrenuti na već zauzetoj poziciji. Više igrača može istodobno iskapati isto slobodno nalazište: njihove misije i rezultati ostaju potpuno neovisni. Isti igrač može istodobno imati samo jedno aktivno Iskopavanje na istoj koordinati.

