Helden zijn factieoverstijgende personages die geleidelijk worden toegevoegd: ze komen beschikbaar zodra ze zijn ingezet en ontwikkelen zich door hun compatibele missies te voltooien. Elk heeft twee accessoirevakken.
De pagina Factie > Helden toont alleen helden die daadwerkelijk beschikbaar zijn, zonder toekomstige vakken weer te geven. Een held kan vrij zijn of aan een missie zijn toegewezen; tijdens die toewijzing blijft hij onbeschikbaar, maar een verandering van factie onderbreekt een missie die al is begonnen niet.
Elke held heeft een eigen lijst met compatibele missies, bonussen en ervaringsregels. Bij het selecteren van een missie worden alleen compatibele helden getoond. Voor Mira Venn wordt de ervaringswinst per uur tijdens Opgravingen toegelicht in Helden bij Opgravingsmissies. Naël Soryn ontvangt 400 XP aan het einde van elke hack op een Pijler die 30 minuten duurt, zelfs als hij wordt gedetecteerd of er geen beweging wordt waargenomen; de Codex verhoogt deze winst op basis van zijn niveau. Mira en Naël doorlopen 20 niveaus, tot 112 650 XP.
Een accessoire dat je bezit kan slechts op één held tegelijk worden uitgerust. Accessoires kunnen alleen worden uitgerust of verwijderd wanneer de held vrij is, ook na een verandering van factie. Accessoires en de voortgang van de held blijven persoonlijk voor de speler. De accessoirecatalogus en de regels voor het overdragen van accessoires worden beschreven in Accessoires voor helden.