Flotila počas letu je technicky nedotknuteľná. Skutočným rizikom je nechať ju stáť na planéte, keď si preč alebo chvíľu nedávaš pozor.
V hre Aleryos nie sú mesiace ani ich ničenie. Flotilu, ktorá už letí, preto nemožno zachytiť týmto typom mechaniky.
Na druhej strane môžu byť útoky veľmi rýchle. Podľa vzdialenosti a zvolenej rýchlosti môže byť planéta, na ktorej zostane tvoja flotila stáť, napadnutá už za 2 min 30 s. Keď je teda flotila umiestnená na planéte, treba zostať ostražitý.
Ak ju chceš chrániť, zvykni ju vysielať na let, keď sa odhlásiš alebo nemôžeš sledovať svoj účet. Môžeš ju poslať na jednu zo svojich planét alebo na externý cieľ podľa svojho zámeru.
Ak chceš pokryť dlhšiu neprítomnosť, pridaj do flotily pomalú loď. Celková rýchlosť závisí od najpomalšej jednotky v skupine, čo ti umožní predĺžiť čas letu a prispôsobiť ho dĺžke svojej neaktivity.
Používaj aj medzihviezdne senzory: umožňujú ti sledovať prichádzajúce aj odchádzajúce flotily, takže môžeš účinnejšie reagovať, keď sa flotila blíži alebo prebieha dôležitý presun. Tlačidlo „Lokalizovať v galaxii“ po kliknutí vycentruje mapu na polohu flotily, ak je jej trajektória dostupná. Kliknutím na flotilu na mape otvoríš jej podrobnosti v senzoroch a zobrazí sa obvyklá pripomienka pre flotily, na ktoré sa vzťahuje. V Nastavenia > Server môžeš v Senzoroch skryť nepriateľské útoky, ktoré sú ešte príliš vzdialené; automaticky sa tam znova zobrazia, len čo vstúpia do zvoleného časového okna. Tento filter ovplyvňuje iba Senzory. Na mape zostávajú viditeľné útoky namierené proti tebe aj útoky Tulákov namierené proti tvojim spojencom.

