Wykopaliska to naziemna misja PvE uruchamiana z Operacje → Filary → Wykopaliska. Wysyła zespół na stanowisko archeologiczne, aby wydobyć rzadkie zasoby lub fragmenty akcesoriów, z szansą na przebudzenie wrogiej obecności.
Wykopaliska są niezależne od eksploracji: nie wymagają floty, nie podlegają wpływowi środowiska zewnętrznego i nie można ich ręcznie odwołać. Każde zajmuje jedno miejsce w globalnym limicie aktywnych misji; limit i sposób jego naliczania opisano w sekcji Rozpoczynanie wykopalisk i ich liczba.
Każde wolne miejsce na planecie otrzymuje na stałe losowy profil stanowiska. W widoku Galaktyka wybierz miejsce, w którym dostępne są wykopaliska, a następnie przygotuj zespół za pośrednictwem Filarów; mapa nie korzysta już z ponumerowanych pozycji w obrębie układu. Profil pozostaje przypisany do miejsca, dopóki nie zostanie ono skolonizowane, ale wykopalisk nie można rozpocząć w miejscu już zajętym. Kilku graczy może jednocześnie prowadzić wykopaliska na tym samym wolnym stanowisku: ich misje i wyniki pozostają całkowicie niezależne. Ten sam gracz może mieć tam jednocześnie tylko jedno aktywne wykopalisko. Zobacz Poruszanie się po ciągłej mapie, aby odróżnić te miejsca od punktów PvE.

