Vykopávka je pozemní PvE mise spuštěná přes Operace → Pilíře → Vykopávka. Vysílá tým na archeologické naleziště, aby získal vzácné suroviny nebo fragmenty doplňků, přičemž může probudit nepřátelskou přítomnost.
Vykopávky jsou nezávislé na průzkumech: nevyžadují flotilu, nejsou ovlivněny vnějším prostředím a nelze je ručně odvolat. Každá zabírá jedno místo v globální kvótě aktivních misí; limit a způsob započítávání jsou popsány v Spuštění a počet vykopávek.
Každá planetární pozice od 1 do 10 má trvale přiřazený náhodný profil naleziště. Profil tam zůstává, dokud není pozice kolonizována, vykopávku však nelze zahájit na již obsazené pozici. Několik hráčů může současně provádět vykopávky na stejném volném nalezišti: jejich mise i výsledky zůstávají zcela nezávislé. Jeden hráč může mít na daných souřadnicích aktivní pouze jednu vykopávku.

