Flotila v letu je technicky nedotknutelná. Skutečné riziko spočívá v tom, že ji během nepřítomnosti nebo chvilky nepozornosti necháš stát na planetě.
V Aleryos nejsou měsíce ani jejich ničení. Flotilu, která už letí, proto nelze zachytit tímto typem mechaniky.
Útoky naopak mohou být velmi rychlé. V závislosti na vzdálenosti a rychlosti může být planeta, na níž tvoje flotila zůstává stát, napadena už za 2 min 30 s. Když tedy flotila stojí na planetě, měj se na pozoru.
Chceš-li ji ochránit, pošli ji na let, když se odhlašuješ nebo nemůžeš sledovat svůj účet. Podle svého záměru ji můžeš poslat k jedné ze svých planet nebo k externímu cíli.
Chceš-li pokrýt delší nepřítomnost, přidej do flotily pomalou loď. Celková rychlost závisí na nejpomalejší jednotce ve skupině, takže můžeš prodloužit dobu letu a přizpůsobit ji délce své nečinnosti.
Používej také mezihvězdné senzory: zobrazují příchozí i odchozí flotily, takže můžeš lépe reagovat, když se flotila blíží nebo probíhá důležitý přesun. Tlačítko „Najít v galaxii“ po kliknutí vycentruje mapu na polohu flotily, pokud je její trajektorie dostupná. Kliknutím na flotilu na mapě otevřeš její podrobnosti v senzorech a zůstane zachována obvyklá připomínka pro flotily, které splňují podmínky. V Nastavení > Server můžeš v senzorech skrýt nepřátelské útoky, které jsou ještě příliš daleko; automaticky se tam znovu zobrazí, jakmile vstoupí do zvoleného časového okna. Tento filtr ovlivňuje pouze senzory. Na mapě zůstávají viditelné útoky mířící na tebe i útoky Bludných mířící na tvé spojence.

